Anthropic Claude Science ha lanciato la beta pubblica di un ambiente per la ricerca scientifica supportato dall’integrazione con il NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit, che accelera le ricerche del settore delle scienze della vita. La piattaforma permette agli scienziati di svolgere compiti end-to-end conversando direttamente con agenti digitali.
Il toolkit NVIDIA connette natively la piattaforma Claud Science ad ambienti di alte prestazioni, rendendo utilizzabili le risorse del toolkit BioNeMo come abilità eseguibili all’interno dell’ambiente di lavoro. NVIDIA mette a disposizione un’architettura estremamente completa, composta da hardware GPU, framework software, librerie, modelli scientifici e strumenti di microservizi dedicati.
Gli scienziati possono adesso importare modelli accelerate NVIDIA e strumenti di elaborazione con la BioNeMo Toolkit, che vengono integrati direttamente nell’ambiente di ricerca. Otto dei dieci principali produttori farmaceutici al mondo utilizzano già NVIDIA BioNeMo nei loro ambienti operativi, dimostrando la sua ampia adozione nel settore.
Il traduttore naturale della lingua in azioni operative
Claude Science trasforma l'intento espresso in linguaggio naturale in operazioni eseguibili. Gli agenti automatici interpretano compiti complessi come l’analisi di una sequenza genetica o la previsione della struttura di una proteina e avviano il corrispondente pipeline di calcolo. Gli scienziati non sono più costretti a configurare i modelli predittivi, stabilire endpoint di rete o gestire ambienti software complessi.
Il ciclo di iterazione scienza-digitale
Lo scienziato esegue l’analisi e i dati vengono restituiti all’ambiente per un successivo miglioramento. Ciò crea un ciclo continuo in cui il ricercatore può concentrarsi esclusivamente sulle questioni scientifiche di base, delegando il lavoro elaborativo al digital agent.
Esempio pratico: la progettazione di farmaci inibitori
Un esempio concreto riguarda la produzione di inibitori per bersagli oncologici comuni. Lo scienziato inizia con la descrizione di una mutazione conosciuta associata a un antigene tumorale. Richiede all’ambiente di suggerire un piano per progettare diversi inibitori potenziali. Claude Science, in collaborazione con i toolkit e i microservizi BioNeMo, accelera l'intera pipeline, dalla predizione ad alta produttività all’ottimizzazione e successiva convalida.
Lavorare con dati genomici e celle singole
Il toolkit fornisce accesso a modelli accelerati e modelli aperti come Evo 2, Boltz-2 e OpenFold3. Questi strumenti permettono di sfruttare il potenziale offerto da librerie software NVIDIA, garantendo che ogni fase della pipeline abbia a disposizione un modello scientifico adatto.
Può essere necessario che agenti automatici svolgano una serie di compiti complessi, ad esempio: identificare una biblioteca di composti, clusterizzare molecole promettenti e analizzare la risposta di perturbazione. L’uso di strumenti accelerati permette ai ricercatori di ridurre drasticamente i tempi di esecuzione.
Lavoro accelerato e tempi ridotti
- Le analisi genomiche, processate con NVIDIA Parabricks, vanno da ore a alcuni minuti.
- Il pre-processamento e il clustering su 1.3 milioni di celle vengono ridotti da 52 minuti a 25 secondi grazie a RAPIDS-singlecell.
- La generazione di conformer e le ricerche di similitudine vengono accelerate fino a 3000 volte con la nvMolKit.
Microservizi per la distribuzione standardizzata
Per facilitare i complessi pipeline di modellazione, NVIDIA ha reso disponibili i modelli biologici aperti come microservizi NIM. Questi offrono endpoint di inferenza per ambienti di produzione enterprise-ready.
I microservizi sono interamente containerizzati, dotati di stack software pre-integrato e ottimizzato per il deployment ad alte prestazioni. Una singola API permette agli agenti autonomi di attivare i servizi remoto.
Agnostico e flessibile
Gli strumenti BioNeMo sono flessibili e possono essere usati in diversi framework senza problemi. Sono progettati per funzionare in modo coerente su piattaforme di ricerca indipendenti o all’interno di sistemi aziendali.
Risorse disponibili e feedback
I team di ingegneria possono ottenere il toolkit e le relative abilità scientifiche utilizzando le risorse di sviluppo di NVIDIA e i repository GitHub. Anthropic, che gestisce la fase beta attiva di Claude Science, invita gli scienziati a fornire commenti diretti sugli strumenti necessari e sugli esperti da includere.
Il progetto ha un potenziale enorme nel settore della ricerca in ambito biologico, permettendo di accelerare e semplificare processi che fino a poco tempo fa richiedevano tempi molto lunghi.